Japan-Places.com ha enumerado aproximadamente 133 Museo de historia natural en Japón. Algunos de los Museo de historia naturalmejor calificados en Japón son- El Museo de la Universidad La Universidad de Tokio, Tamba Municipal Tamba Ryu Fossil Studio Chitan no Yakata, Museo Yakusugi, Museo de insectos de Nawa, Museo de insectos de Nawa, Aquapia Akutagawa, museo de aguas profundas, Museo Daisen de Naturaleza e Historia, Museo Daisen de Naturaleza e Historia & Centro de aves silvestres de Kohoku.